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  • P-ISSN1225-0163
  • E-ISSN2288-8985
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21권 4호
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유골에서 DNA 추출법 비교 연구: Ultrafiltration과 Column affinity

Evaluation of two DNA extraction methods on exhumed bone samples:Ultrafiltration versus column affinity

분석과학 / Analytical Science and Technology, (P)1225-0163; (E)2288-8985
2008, v.21 no.4, pp.338-343
김순희 (국립과학수사연구소)
홍승범 (국립과학수사연구소 유전자분석과)
브라이언 M.켐프 (워싱턴대학교 생명과학부)
박기원 (국립과학수사연구소)
한면수 (국립과학수사연구소 유전자분석과)
김순희, 홍승범, 브라이언 M.켐프, 박기원, & 한면수. (2008). 유골에서 DNA 추출법 비교 연구: Ultrafiltration과 Column affinity. 분석과학, 21(4), 338-343.
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초록

발굴된 유골에서 DNA 추출은 DNA신원확인과정에서 매우 중요한 단계이지만 유골에 오염된 미생물 DNA와 사람 DNA가 동시에 추출되는 문제점이 있다. 이를 극복하기 위해 발굴된 10명의 유골 시료를 페놀-ultrafiltration 후 <TEX>$QIAquick^{(R)}$</TEX> PCR Purification Kit (ultrafiltration법)와 <TEX>$QIAamp^{(R)}$</TEX> DNA Mini kit(Column-affinity법)를 적용하여 전체(미생물+사람) DNA정량 및 사람 DNA정량 후 각각 STR마커를 분석하므로서 DNA 분리 효율성을 확인하였다. 회수된 전체 DNA양은 Column-affinity법(<TEX>$19.6ng/{\mu}L$</TEX>)이 ultrafiltration법(<TEX>$16.0ng/{\mu}L$</TEX>) 보다 1.2배 더 나은 결과를 보였으나 사람 DNA 정량 결과로는 Column-affinity 법(<TEX>$0.034ng/{\mu}L$</TEX>) 보다 ultrafiltration법(<TEX>$0.498ng/{\mu}L$</TEX>)이 14.6배 더 많은 회수율을 나타냈다. 유골에 있던 다량의 미생물 DNA가 사람 DNA와 섞여있을 경우, 사람 DNA가 실리카 친화성 컬럼에 부착되는 것이 미생물 DNA의 영향을 받으나, 필터의 경우는 미생물 DNA의 영향을 받지 않아서 ultrafiltration법이 높은 회수율을 보였다.

keywords
forensic sciences, DNA extraction, bone, microbial DNA contamination

Abstract

발굴된 유골에서 DNA 추출은 DNA신원확인과정에서 매우 중요한 단계이지만 유골에 오염된 미 생물 DNA와 사람 DNA가 동시에 추출되는 문제점이 있다. 이를 극복하기 위해 발굴된 10명의 유골 시 료를 페놀-ultrafiltration 후 QIAquick® PCR Purification Kit (ultrafiltration법)와 QIAamp® DNA Mini kit(Column-affinity법)를 적용하여 전체(미생물+사람) DNA정량 및 사람 DNA정량 후 각각 STR마커를 분 석하므로서 DNA 분리 효율성을 확인하였다. 회수된 전체 DNA양은 Column-affinity법(19.6 ng/μL)이 ultrafiltration법(16.0 ng/μL) 보다 1.2배 더 나은 결과를 보였으나 사람 DNA 정량 결과로는 Column-affinity 법(0.034 ng/μL) 보다 ultrafiltration법(0.498 ng/μL)이 14.6배 더 많은 회수율을 나타냈다. 유골에 있던 다 량의 미생물 DNA가 사람 DNA와 섞여있을 경우, 사람 DNA가 실리카 친화성 컬럼에 부착되는 것이 미 생물 DNA의 영향을 받으나, 필터의 경우는 미생물 DNA의 영향을 받지 않아서 ultrafiltration법이 높은 회 수율을 보였다.

keywords
forensic sciences, DNA extraction, bone, microbial DNA contamination


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